Является специалистом в области ароматического нуклеофильного замещения, химии гетероциклических соединений. Ею разработаны оригинальные методы синтеза азот-, серу- и кислородсодержащих ароматических, гетероароматических, алициклических соединений, получено более 10 тысяч новых не описанных ранее в литературе соединений.
Под руководством Шахкельдян И.В. подготовлено и защищено 3 кандидатские диссертации, в настоящее время является руководителем 2 аспирантов.
Является автором и соавтором более 300 научных публикаций. За последнее время были опубликованы следующие:
1. «Синтез и анализ n-(4-(бензо[d]тиазол-2-ил)фенил)сульфонамидов», Атрощенко Ю.М., Никишина М.Б., Мухторов Л.Г., Иванова Е.В., Шахкельдян И.В., Уральский научный вестник. 2022. Т. 4. № 12. С. 26-29.
2. «Изучение противогрибковой активности новых производных 2-r-3,5-динитропиридинов», Сурова И.И., Иванова Е.В., Мухторов Л.Г., Никишина М.Б., Атрощенко Ю.М., Шахкельдян И.В., Уральский научный вестник. 2022. Т. 4. № 12. С. 38-40.
3. «Влияние новых производных 2-R-3,5-динитропиридинов на всхожесть и энергию прорастания семян пшеницы», Иванова Е.В., Сурова И.И., Никишина М.Б., Мухторов Л.Г., Атрощенко Ю.М., Шахкельдян И.В., Уральский научный вестник. 2022. Т. 4. № 12. С. 41-44.
4. «Синтез производных 3-азабицикло[3.3.1]нонана и диазатрицикло[6.3.1.02.6]додека-2(6),4-диена», Мухторов Л.Г., Каримов М.Б., Иванова Е.В., Шахкельдян И.В., Атрощенко Ю.М., Вестник Филиала Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова в городе Душанбе. 2022. Т. 1. № 1 (21). С. 63-71.
5. «Интегративный подход к формированию системы знаний о химических реакциях», Валуева Т.Н., Никишина М.Б., Шахкельдян И.В., Ахромушкина И.М., Корнева Т.М., Известия Тульского государственного университета. Естественные науки. 2021. № 4. С. 3-8.
Награждена значком Министерства просвещения РФ «Отличник народного образования» (1996 год), Почетной грамотой Министерства общего и профессионального образования РФ (1998 год), Нагрудным знаком «Почетный работник высшего профессионального образования РФ» (2003 год).
Медаль Благотворительного фонда наследия Менделеева «За службу образованию» (2011 г.)
Серебряная медаль «За особый вклад в развитие Тульской области», Администрация Тульской области (2013 г.)
Почетная грамота Правительства Тульской области за многолетнее плодотворное сотрудничество и большой вклад в развитие олимпиадного движения в Тульской области (2013 г.)