Является автором 506 научных и учебно-методических трудов.
НАИБОЛЕЕ ЗНАЧИМЫЕ ПУБЛИКАЦИИ
«МЕТАЛЛОТОЛЕРАНТНЫЕ МИКРООРГАНИЗМЫ ОЧИСТНЫХ СООРУЖЕНИЙ КАНАЛИЗАЦИИ КРУПНОГО ГОРОДА», Переломов Л.В., Сизова О.И., Мухторов Л.Г., Переломова И.В., Третьякова А.В., Атрощенко Ю.М., В сборнике: Охрана биоразнообразия и экологические проблемы природопользования. Сборник статей III Всероссийской (национальной) научно-практической конференции. Пенза, 2022. С. 120-123.
«ИССЛЕДОВАНИЕ БИОЛОГИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТИ НОВЫХ ПРОИЗВОДНЫХ 2-R-3,5-ДИНИТРОПИРИДИНОВ», Иванова Е.В., Сурова И.И., Никишина М.Б., Мухторов Л.Г., Атрощенко Ю.М., Бутлеровские сообщения. 2022. Т. 72. No 11. С. 128-133.
Атрощенко Ю.М., Шахкельдян И.В., Якунина И.Е., Субботин В.А. Анионные аддукты нитроаренов в синтезе насыщенных гетероциклических систем // Успехи в нефтехимическом синтезе полифункциональных ароматических соединений (Панорама современной химии России): Сб. обзорн. статей. – М.: Химия, 2005. С. 178-213.