Время науки - The Times of Science

Время науки The Times of Science 42 №2.2 протона от 1,5 до 2,4 Å , ван-дер-ваальсовые взаимодействия определялись по расстоянию от 2,3 Å . Докинг проводили с использованием AutoDOCK 4.0 со следующими параметрами: • Центр ячейки для докинга (Gride Center X): -27.505 Y: -8.5648 Z: - 41.7986; • Number of Points X: 59 Y: 50 Z: 50; • Spacing (Angstrom): 0.3750; • Number of GA runs: 100; • Number of individuals in population: 1500; • Maximum number of energy evaluations: «Long» (25 000 000); • Maximum number of generations: 50 000. Минимизацию молекул проводили методом молекулярной механики с использованием силового поля ММ2. Определение положения кислорода в координации с железом гема устанавливали расчетным способом (рис. 2) [3]. Рис. 2. Межатомные расстояния в активном центре CYP17 Результаты и обсуждение. Установлены следующие аминокислоты, отвечающие за связывание лиганда в активном центре (Таблица 1, рис. 3). Таблица 1 Аминокислоты, отвечающие за связывание лиганда Номер аминокислоты Код Наименование Тип взаимодействий 114 Phe Фенилаланин Гидрофобные 239 Arg Аргинин Водородные связи 306 Thr Треонин Водородные связи